Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR55Q9Y2T6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPR55Q9Y2T6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms