Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOM1Q5C9Z4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NOM1Q5C9Z4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOM1Q5C9Z4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOM1Q5C9Z4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOM1Q5C9Z4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOM1Q5C9Z4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
NOM1Q5C9Z4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOM1Q5C9Z4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOM1Q5C9Z4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOM1Q5C9Z4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOM1Q5C9Z4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOM1Q5C9Z4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NOM1Q5C9Z4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOM1Q5C9Z4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
NOM1Q5C9Z4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NOM1Q5C9Z4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms