Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKRN4PQ13434 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKRN4PQ13434 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKRN4PQ13434 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
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