Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP1A1P05023 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP1A1P05023 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1136.7 ms