Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SETD1BQ9UPS6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SETD1BQ9UPS6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SETD1BQ9UPS6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms