Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMPRSS11EQ9UL52 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMPRSS11EQ9UL52 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS11EQ9UL52 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms