Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD2

MRPL9, 39S ribosomal protein L9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL9Q9BYD2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL9Q9BYD2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL9Q9BYD2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL9Q9BYD2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL9Q9BYD2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL9Q9BYD2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL9Q9BYD2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL9Q9BYD2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL9Q9BYD2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL9Q9BYD2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL9Q9BYD2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL9Q9BYD2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL9Q9BYD2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL9Q9BYD2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL9Q9BYD2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL9Q9BYD2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPL9Q9BYD2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPL9Q9BYD2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPL9Q9BYD2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPL9Q9BYD2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL9Q9BYD2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL9Q9BYD2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL9Q9BYD2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL9Q9BYD2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL9Q9BYD2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL9Q9BYD2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL9Q9BYD2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL9Q9BYD2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL9Q9BYD2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL9Q9BYD2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL9Q9BYD2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL9Q9BYD2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL9Q9BYD2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL9Q9BYD2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL9Q9BYD2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL9Q9BYD2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL9Q9BYD2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL9Q9BYD2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL9Q9BYD2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL9Q9BYD2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms