Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TSR2Q969E8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TSR2Q969E8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TSR2Q969E8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms