Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.27■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PCOLCEQ15113 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCOLCEQ15113 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCOLCEQ15113 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCOLCEQ15113 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PCOLCEQ15113 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCOLCEQ15113 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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