Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCOLCEQ15113 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PCOLCEQ15113 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PCOLCEQ15113 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PCOLCEQ15113 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PCOLCEQ15113 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PCOLCEQ15113 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31■■■□□ 2.55
PCOLCEQ15113 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PCOLCEQ15113 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PCOLCEQ15113 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCOLCEQ15113 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PCOLCEQ15113 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCOLCEQ15113 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCOLCEQ15113 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PCOLCEQ15113 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCOLCEQ15113 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCOLCEQ15113 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCOLCEQ15113 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PCOLCEQ15113 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PCOLCEQ15113 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCOLCEQ15113 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCOLCEQ15113 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PCOLCEQ15113 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PCOLCEQ15113 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCOLCEQ15113 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCOLCEQ15113 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCOLCEQ15113 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCOLCEQ15113 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCOLCEQ15113 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCOLCEQ15113 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCOLCEQ15113 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCOLCEQ15113 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCOLCEQ15113 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCOLCEQ15113 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCOLCEQ15113 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCOLCEQ15113 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCOLCEQ15113 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCOLCEQ15113 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PCOLCEQ15113 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCOLCEQ15113 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCOLCEQ15113 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCOLCEQ15113 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCOLCEQ15113 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCOLCEQ15113 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCOLCEQ15113 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCOLCEQ15113 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCOLCEQ15113 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PCOLCEQ15113 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCOLCEQ15113 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PCOLCEQ15113 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCOLCEQ15113 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCOLCEQ15113 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCOLCEQ15113 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCOLCEQ15113 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCOLCEQ15113 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCOLCEQ15113 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCOLCEQ15113 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCOLCEQ15113 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCOLCEQ15113 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCOLCEQ15113 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCOLCEQ15113 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCOLCEQ15113 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCOLCEQ15113 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCOLCEQ15113 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCOLCEQ15113 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCOLCEQ15113 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCOLCEQ15113 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCOLCEQ15113 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PCOLCEQ15113 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PCOLCEQ15113 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCOLCEQ15113 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCOLCEQ15113 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PCOLCEQ15113 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCOLCEQ15113 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCOLCEQ15113 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCOLCEQ15113 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCOLCEQ15113 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCOLCEQ15113 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCOLCEQ15113 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCOLCEQ15113 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCOLCEQ15113 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCOLCEQ15113 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCOLCEQ15113 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCOLCEQ15113 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCOLCEQ15113 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCOLCEQ15113 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCOLCEQ15113 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCOLCEQ15113 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCOLCEQ15113 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PCOLCEQ15113 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCOLCEQ15113 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCOLCEQ15113 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCOLCEQ15113 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCOLCEQ15113 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCOLCEQ15113 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PCOLCEQ15113 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCOLCEQ15113 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCOLCEQ15113 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCOLCEQ15113 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCOLCEQ15113 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
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