Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNA1Q09470 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNA1Q09470 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms