Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VAMP1P23763 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms