Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APODP05090 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APODP05090 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APODP05090 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APODP05090 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APODP05090 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APODP05090 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APODP05090 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APODP05090 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APODP05090 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APODP05090 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APODP05090 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APODP05090 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
APODP05090 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APODP05090 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APODP05090 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
APODP05090 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APODP05090 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APODP05090 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APODP05090 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APODP05090 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APODP05090 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APODP05090 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APODP05090 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APODP05090 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APODP05090 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APODP05090 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APODP05090 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APODP05090 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APODP05090 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APODP05090 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APODP05090 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APODP05090 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APODP05090 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APODP05090 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APODP05090 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APODP05090 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
APODP05090 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APODP05090 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
APODP05090 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
APODP05090 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APODP05090 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APODP05090 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APODP05090 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APODP05090 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APODP05090 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APODP05090 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APODP05090 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APODP05090 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APODP05090 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APODP05090 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APODP05090 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APODP05090 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
APODP05090 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APODP05090 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APODP05090 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APODP05090 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APODP05090 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APODP05090 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APODP05090 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APODP05090 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APODP05090 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APODP05090 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APODP05090 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APODP05090 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APODP05090 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APODP05090 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APODP05090 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APODP05090 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APODP05090 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APODP05090 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APODP05090 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APODP05090 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APODP05090 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APODP05090 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APODP05090 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APODP05090 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APODP05090 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APODP05090 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APODP05090 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APODP05090 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APODP05090 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APODP05090 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APODP05090 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APODP05090 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APODP05090 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APODP05090 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APODP05090 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APODP05090 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APODP05090 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APODP05090 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APODP05090 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APODP05090 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APODP05090 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APODP05090 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APODP05090 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APODP05090 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APODP05090 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APODP05090 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APODP05090 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.2 ms