Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DFFAO00273 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DFFAO00273 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DFFAO00273 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DFFAO00273 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DFFAO00273 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DFFAO00273 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DFFAO00273 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DFFAO00273 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DFFAO00273 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DFFAO00273 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DFFAO00273 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DFFAO00273 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DFFAO00273 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DFFAO00273 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DFFAO00273 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DFFAO00273 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DFFAO00273 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DFFAO00273 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DFFAO00273 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DFFAO00273 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DFFAO00273 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DFFAO00273 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DFFAO00273 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DFFAO00273 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DFFAO00273 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DFFAO00273 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DFFAO00273 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DFFAO00273 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DFFAO00273 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DFFAO00273 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DFFAO00273 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DFFAO00273 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DFFAO00273 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DFFAO00273 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DFFAO00273 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DFFAO00273 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DFFAO00273 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DFFAO00273 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DFFAO00273 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DFFAO00273 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DFFAO00273 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DFFAO00273 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DFFAO00273 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DFFAO00273 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DFFAO00273 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DFFAO00273 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DFFAO00273 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DFFAO00273 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DFFAO00273 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DFFAO00273 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DFFAO00273 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DFFAO00273 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DFFAO00273 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DFFAO00273 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DFFAO00273 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DFFAO00273 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DFFAO00273 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DFFAO00273 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DFFAO00273 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DFFAO00273 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DFFAO00273 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DFFAO00273 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DFFAO00273 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DFFAO00273 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DFFAO00273 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DFFAO00273 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DFFAO00273 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DFFAO00273 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DFFAO00273 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DFFAO00273 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DFFAO00273 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DFFAO00273 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DFFAO00273 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DFFAO00273 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DFFAO00273 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DFFAO00273 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DFFAO00273 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DFFAO00273 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DFFAO00273 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DFFAO00273 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DFFAO00273 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DFFAO00273 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DFFAO00273 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DFFAO00273 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DFFAO00273 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DFFAO00273 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DFFAO00273 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DFFAO00273 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DFFAO00273 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DFFAO00273 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DFFAO00273 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DFFAO00273 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DFFAO00273 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DFFAO00273 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DFFAO00273 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DFFAO00273 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DFFAO00273 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DFFAO00273 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DFFAO00273 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms