Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMF1-BGLAPU3KQ54 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms