Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNG4Q9UBN1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNG4Q9UBN1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNG4Q9UBN1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms