Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC31■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
USP35Q9P2H5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
USP35Q9P2H5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
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