Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3CQ99985 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms