Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00208Q96KT6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms