Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPRL3Q12980 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NPRL3Q12980 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPRL3Q12980 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms