Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SSFA2P28290 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SSFA2P28290 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SSFA2P28290 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms