Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALRP27797 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALRP27797 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALRP27797 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALRP27797 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALRP27797 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALRP27797 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALRP27797 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALRP27797 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALRP27797 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALRP27797 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALRP27797 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALRP27797 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALRP27797 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALRP27797 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALRP27797 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CALRP27797 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALRP27797 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CALRP27797 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALRP27797 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALRP27797 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALRP27797 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALRP27797 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALRP27797 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALRP27797 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALRP27797 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALRP27797 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALRP27797 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALRP27797 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALRP27797 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALRP27797 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALRP27797 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALRP27797 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALRP27797 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALRP27797 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALRP27797 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALRP27797 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALRP27797 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALRP27797 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALRP27797 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALRP27797 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALRP27797 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALRP27797 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALRP27797 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALRP27797 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALRP27797 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALRP27797 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALRP27797 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALRP27797 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALRP27797 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALRP27797 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALRP27797 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALRP27797 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALRP27797 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CALRP27797 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALRP27797 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALRP27797 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALRP27797 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALRP27797 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALRP27797 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALRP27797 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALRP27797 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALRP27797 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALRP27797 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALRP27797 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALRP27797 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALRP27797 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALRP27797 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALRP27797 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALRP27797 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALRP27797 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALRP27797 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CALRP27797 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CALRP27797 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALRP27797 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALRP27797 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALRP27797 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALRP27797 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALRP27797 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALRP27797 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALRP27797 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALRP27797 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALRP27797 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALRP27797 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALRP27797 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALRP27797 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALRP27797 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALRP27797 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALRP27797 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALRP27797 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALRP27797 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALRP27797 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALRP27797 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALRP27797 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CALRP27797 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALRP27797 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALRP27797 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALRP27797 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALRP27797 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALRP27797 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms