Protein–RNA interactions for Protein: O60635

TSPAN1, Tetraspanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN1O60635 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN1O60635 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSPAN1O60635 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN1O60635 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms