Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3KR12 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3KR12 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3KR12 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3KR12 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3KR12 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
J3KR12 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
J3KR12 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
J3KR12 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
J3KR12 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
J3KR12 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
J3KR12 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
J3KR12 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
J3KR12 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
J3KR12 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
J3KR12 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
J3KR12 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
J3KR12 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
J3KR12 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
J3KR12 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
J3KR12 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
J3KR12 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
J3KR12 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
J3KR12 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
J3KR12 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
J3KR12 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
J3KR12 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
J3KR12 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
J3KR12 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
J3KR12 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
J3KR12 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
J3KR12 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
J3KR12 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
J3KR12 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
J3KR12 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
J3KR12 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
J3KR12 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
J3KR12 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
J3KR12 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
J3KR12 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
J3KR12 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
J3KR12 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
J3KR12 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
J3KR12 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
J3KR12 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
J3KR12 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
J3KR12 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
J3KR12 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
J3KR12 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
J3KR12 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
J3KR12 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
J3KR12 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
J3KR12 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
J3KR12 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
J3KR12 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
J3KR12 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
J3KR12 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
J3KR12 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
J3KR12 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
J3KR12 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
J3KR12 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3KR12 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3KR12 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3KR12 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3KR12 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3KR12 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3KR12 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3KR12 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3KR12 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3KR12 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3KR12 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3KR12 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3KR12 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3KR12 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
J3KR12 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3KR12 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
J3KR12 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
J3KR12 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
J3KR12 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
J3KR12 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
J3KR12 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
J3KR12 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
J3KR12 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
J3KR12 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
J3KR12 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
J3KR12 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
J3KR12 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
J3KR12 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
J3KR12 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
J3KR12 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
J3KR12 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
J3KR12 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
J3KR12 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
J3KR12 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
J3KR12 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
J3KR12 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
J3KR12 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
J3KR12 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
J3KR12 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
J3KR12 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms