Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRMT1Q9NXH9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRMT1Q9NXH9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms