Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NMD3Q96D46 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms