Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFT2D1Q8WV19 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms