Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OPN5Q6U736 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.27■■□□□ 1
OPN5Q6U736 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
OPN5Q6U736 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OPN5Q6U736 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OPN5Q6U736 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OPN5Q6U736 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OPN5Q6U736 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OPN5Q6U736 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
OPN5Q6U736 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPN5Q6U736 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms