Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
C4orf17Q53FE4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C4orf17Q53FE4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C4orf17Q53FE4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
C4orf17Q53FE4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C4orf17Q53FE4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C4orf17Q53FE4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
C4orf17Q53FE4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C4orf17Q53FE4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C4orf17Q53FE4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C4orf17Q53FE4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C4orf17Q53FE4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C4orf17Q53FE4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C4orf17Q53FE4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms