Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CUL1Q13616 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CUL1Q13616 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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