Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 TAF1C-218ENST00000567759 3879 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.962e-6■■□□□ 13
SRSF9Q13242 TAF1C-209ENST00000564208 3810 ntTSL 28.85□□□□□ -0.992e-6■■□□□ 13
SRSF9Q13242 MED16-209ENST00000592943 1628 ntTSL 1 (best)11.9□□□□□ -0.51e-6■■□□□ 12.9
SRSF9Q13242 MED16-212ENST00000607471 2004 ntTSL 1 (best)11.78□□□□□ -0.521e-6■■□□□ 12.9
SRSF9Q13242 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.541e-6■■□□□ 12.9
SRSF9Q13242 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.61e-6■■□□□ 12.9
SRSF9Q13242 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.671e-6■■□□□ 12.9
SRSF9Q13242 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.681e-6■■□□□ 12.9
SRSF9Q13242 MED16-210ENST00000606248 3181 ntTSL 1 (best)10.51□□□□□ -0.731e-6■■□□□ 12.9
SRSF9Q13242 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.751e-6■■□□□ 12.9
SRSF9Q13242 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.751e-6■■□□□ 12.9
SRSF9Q13242 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.821e-6■■□□□ 12.9
SRSF9Q13242 MED16-205ENST00000586017 1403 ntTSL 1 (best)9.16□□□□□ -0.941e-6■■□□□ 12.9
SRSF9Q13242 MED16-211ENST00000606828 599 ntTSL 1 (best)8.45□□□□□ -1.061e-6■■□□□ 12.9
SRSF9Q13242 NAP1L1-223ENST00000552013 679 ntTSL 24.21□□□□□ -1.741e-6■■□□□ 12.9
SRSF9Q13242 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.331e-8■■□□□ 12.9
SRSF9Q13242 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.341e-8■■□□□ 12.9
SRSF9Q13242 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.371e-6■■□□□ 12.8
SRSF9Q13242 SLC38A2-213ENST00000553252 846 ntTSL 211.05□□□□□ -0.644e-11■■□□□ 12.8
SRSF9Q13242 SLC38A2-210ENST00000551405 526 ntTSL 410.18□□□□□ -0.784e-11■■□□□ 12.8
SRSF9Q13242 SLC38A2-201ENST00000256689 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.184e-11■■□□□ 12.8
SRSF9Q13242 SLC38A2-208ENST00000549258 4384 ntTSL 23.32□□□□□ -1.884e-11■■□□□ 12.8
SRSF9Q13242 NR1H4-202ENST00000321046 1779 ntTSL 1 (best)8.17□□□□□ -1.12e-9■■□□□ 12.8
SRSF9Q13242 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.12e-9■■□□□ 12.8
SRSF9Q13242 NR1H4-201ENST00000188403 1630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.252e-9■■□□□ 12.8
SRSF9Q13242 NR1H4-207ENST00000549996 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.262e-9■■□□□ 12.8
SRSF9Q13242 NR1H4-209ENST00000551379 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.392e-9■■□□□ 12.8
SRSF9Q13242 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.542e-9■■□□□ 12.8
SRSF9Q13242 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.443e-6■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.489e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.599e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 DDB2-212ENST00000617022 2181 ntTSL 211.6□□□□□ -0.557e-8■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 DDB2-203ENST00000378601 1591 ntTSL 211.07□□□□□ -0.647e-8■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 DDB2-216ENST00000622878 556 ntTSL 49.9□□□□□ -0.827e-8■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.917e-8■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 DDB2-215ENST00000622090 580 ntTSL 57.75□□□□□ -1.177e-8■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 DDB2-205ENST00000610805 793 ntTSL 57.21□□□□□ -1.267e-8■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 DDB2-208ENST00000614825 852 ntTSL 37.15□□□□□ -1.267e-8■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 DDB2-211ENST00000616278 960 ntTSL 27□□□□□ -1.297e-8■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 DDB2-202ENST00000378600 717 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.297e-8■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 DDB2-204ENST00000378603 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.297e-8■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 DDB2-206ENST00000612309 3101 ntTSL 26.84□□□□□ -1.317e-8■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 DDB2-210ENST00000615695 897 ntTSL 26.7□□□□□ -1.347e-8■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.565e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.515e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 KAZN-206ENST00000491547 5592 ntTSL 216.18■□□□□ 0.185e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.175e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.155e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.155e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.15e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.095e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.135e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.195e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.255e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 AL121845.3-202ENST00000632538 872 ntAPPRIS P1 TSL 313.28□□□□□ -0.285e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 UBE2G2-205ENST00000478200 637 ntTSL 413□□□□□ -0.335e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 UBE2G2-212ENST00000497664 590 ntTSL 413□□□□□ -0.335e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.345e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 ZGPAT-208ENST00000472711 787 ntTSL 312.37□□□□□ -0.435e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.475e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.475e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 ZGPAT-209ENST00000477340 2831 ntTSL 212.11□□□□□ -0.475e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 UBE2G2-209ENST00000491513 744 ntTSL 412.03□□□□□ -0.485e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 CYBA-203ENST00000562209 624 ntTSL 512.02□□□□□ -0.495e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 UBE2G2-211ENST00000497630 933 ntTSL 211.94□□□□□ -0.55e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 CCDC142-204ENST00000471713 1035 ntTSL 511.18□□□□□ -0.625e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 ZGPAT-211ENST00000484569 749 ntTSL 211.07□□□□□ -0.645e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.75e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 ZGPAT-210ENST00000478385 935 ntTSL 210.63□□□□□ -0.715e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.715e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 UBE2G2-204ENST00000477954 1034 ntTSL 39.93□□□□□ -0.825e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 CYBA-202ENST00000561972 464 ntTSL 39.79□□□□□ -0.845e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.865e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 CYBA-204ENST00000563526 1052 ntTSL 29.59□□□□□ -0.875e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 CCDC142-207ENST00000474681 735 ntTSL 59.22□□□□□ -0.935e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.945e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 CYBA-206ENST00000566229 405 ntTSL 38.68□□□□□ -1.025e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 CYBA-207ENST00000566534 1006 ntTSL 58.68□□□□□ -1.025e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.025e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 CYBA-209ENST00000568278 439 ntTSL 58.09□□□□□ -1.115e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 KAZN-202ENST00000376028 800 ntTSL 37.93□□□□□ -1.145e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 UBE2G2-206ENST00000481546 4340 ntTSL 1 (best)6.94□□□□□ -1.35e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 CA5A-202ENST00000566402 725 ntTSL 24.81□□□□□ -1.645e-7■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 AHSA2-205ENST00000471542 1971 ntTSL 210.54□□□□□ -0.727e-10■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.483e-6■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 LINC00511-210ENST00000580861 467 ntTSL 45.96□□□□□ -1.463e-6■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 RAB17-210ENST00000477149 3211 ntTSL 1 (best)10.66□□□□□ -0.71e-6■■□□□ 12.7
SRSF9Q13242 HEXIM1-201ENST00000332499 3600 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.876e-7■■□□□ 12.6
SRSF9Q13242 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.071e-6■■□□□ 12.6
SRSF9Q13242 CSNK1D-221ENST00000582844 957 ntTSL 513.18□□□□□ -0.31e-6■■□□□ 12.6
SRSF9Q13242 CSNK1D-217ENST00000581241 6094 ntTSL 212.74□□□□□ -0.371e-6■■□□□ 12.6
SRSF9Q13242 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.591e-6■■□□□ 12.6
SRSF9Q13242 CSNK1D-201ENST00000269361 1088 ntTSL 510.86□□□□□ -0.671e-6■■□□□ 12.6
SRSF9Q13242 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.711e-6■■□□□ 12.6
SRSF9Q13242 CSNK1D-205ENST00000403276 1040 ntTSL 210.37□□□□□ -0.751e-6■■□□□ 12.6
SRSF9Q13242 CSNK1D-209ENST00000578904 1269 ntTSL 39.2□□□□□ -0.941e-6■■□□□ 12.6
SRSF9Q13242 CSNK1D-213ENST00000580446 612 ntTSL 38.68□□□□□ -1.021e-6■■□□□ 12.6
SRSF9Q13242 CSNK1D-219ENST00000581660 611 ntTSL 58.62□□□□□ -1.031e-6■■□□□ 12.6
SRSF9Q13242 CSNK1D-207ENST00000578194 567 ntTSL 47.79□□□□□ -1.161e-6■■□□□ 12.6
SRSF9Q13242 PSME4-208ENST00000481518 886 ntTSL 514.21□□□□□ -0.131e-6■■□□□ 12.6
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