RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606828.2

MED16-211, Transcript of mediator complex subunit 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MED16, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16-211ENST00000606828 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.41■■■□□ 2.94
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MED16-211ENST00000606828 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.11■■■□□ 2.09
MED16-211ENST00000606828 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.08■■■□□ 2.09
MED16-211ENST00000606828 NACADO15069 1562 aa28.05■■■□□ 2.08
MED16-211ENST00000606828 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.83■■■□□ 2.05
MED16-211ENST00000606828 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
MED16-211ENST00000606828 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.64■■■□□ 2.02
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MED16-211ENST00000606828 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.35■■□□□ 1.97
MED16-211ENST00000606828 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.23■■□□□ 1.95
MED16-211ENST00000606828 SCRIBQ14160 1630 aa27.13■■□□□ 1.93
MED16-211ENST00000606828 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.08■■□□□ 1.93
MED16-211ENST00000606828 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27■■□□□ 1.91
MED16-211ENST00000606828 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
MED16-211ENST00000606828 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.48■■□□□ 1.83
MED16-211ENST00000606828 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.38■■□□□ 1.81
MED16-211ENST00000606828 SMARCA4P51532 1647 aa25.93■■□□□ 1.74
MED16-211ENST00000606828 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
MED16-211ENST00000606828 NCAPD3P42695 1498 aa25.91■■□□□ 1.74
MED16-211ENST00000606828 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.88■■□□□ 1.73
MED16-211ENST00000606828 SMARCA2P51531 1590 aa25.84■■□□□ 1.73
MED16-211ENST00000606828 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.73■■□□□ 1.71
MED16-211ENST00000606828 HMGXB3Q12766 1538 aa25.73■■□□□ 1.71
MED16-211ENST00000606828 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.69■■□□□ 1.7
MED16-211ENST00000606828 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
MED16-211ENST00000606828 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
MED16-211ENST00000606828 WIZO95785 1651 aa25.41■■□□□ 1.66
MED16-211ENST00000606828 ERCC6Q03468 1493 aa25.32■■□□□ 1.64
MED16-211ENST00000606828 NESP48681 1621 aa25.3■■□□□ 1.64
MED16-211ENST00000606828 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.22■■□□□ 1.63
MED16-211ENST00000606828 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
MED16-211ENST00000606828 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.16■■□□□ 1.62
MED16-211ENST00000606828 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.12■■□□□ 1.61
MED16-211ENST00000606828 CUX2O14529 1486 aa25.09■■□□□ 1.61
MED16-211ENST00000606828 CFTRP13569 1480 aa24.96■■□□□ 1.59
MED16-211ENST00000606828 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.94■■□□□ 1.58
MED16-211ENST00000606828 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
MED16-211ENST00000606828 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.89■■□□□ 1.58
MED16-211ENST00000606828 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.84■■□□□ 1.57
MED16-211ENST00000606828 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.83■■□□□ 1.57
MED16-211ENST00000606828 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.83■■□□□ 1.56
MED16-211ENST00000606828 WDR62O43379 1518 aa24.74■■□□□ 1.55
MED16-211ENST00000606828 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
MED16-211ENST00000606828 PRDM2Q13029 1718 aa24.61■■□□□ 1.53
MED16-211ENST00000606828 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
MED16-211ENST00000606828 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.57■■□□□ 1.52
MED16-211ENST00000606828 ABCC8Q09428 1581 aa24.44■■□□□ 1.5
MED16-211ENST00000606828 TOPBP1Q92547 1522 aa24.41■■□□□ 1.5
MED16-211ENST00000606828 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.36■■□□□ 1.49
MED16-211ENST00000606828 IFT140Q96RY7 1462 aa24.33■■□□□ 1.49
MED16-211ENST00000606828 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
MED16-211ENST00000606828 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
MED16-211ENST00000606828 CUX1P39880 1505 aa24.15■■□□□ 1.46
MED16-211ENST00000606828 SOGA1O94964 1423 aa24.13■■□□□ 1.45
MED16-211ENST00000606828 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
MED16-211ENST00000606828 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.12■■□□□ 1.45
MED16-211ENST00000606828 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.1■■□□□ 1.45
MED16-211ENST00000606828 OSCARQ8IYS5 282 aa24.08■■□□□ 1.45
MED16-211ENST00000606828 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
MED16-211ENST00000606828 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.442e-6■■■■□ 25.8
MED16-211ENST00000606828 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
MED16-211ENST00000606828 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.43
MED16-211ENST00000606828 WDR97A6NE52 1622 aa23.95■■□□□ 1.43
MED16-211ENST00000606828 TOP2BQ02880 1626 aa23.89■■□□□ 1.42
MED16-211ENST00000606828 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.88■■□□□ 1.41
MED16-211ENST00000606828 FBLN2P98095 1184 aa23.87■■□□□ 1.41
MED16-211ENST00000606828 SYNJ1O43426 1573 aa23.86■■□□□ 1.41
MED16-211ENST00000606828 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.86■■□□□ 1.41
MED16-211ENST00000606828 GRIN2BQ13224 1484 aa23.86■■□□□ 1.41
MED16-211ENST00000606828 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.83■■□□□ 1.41
MED16-211ENST00000606828 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.83■■□□□ 1.41
MED16-211ENST00000606828 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
MED16-211ENST00000606828 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
MED16-211ENST00000606828 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.76■■□□□ 1.39
MED16-211ENST00000606828 CHD1O14646 1710 aa23.76■■□□□ 1.39
MED16-211ENST00000606828 SYNJ2O15056 1496 aa23.72■■□□□ 1.39
MED16-211ENST00000606828 PBRM1Q86U86 1689 aa23.7■■□□□ 1.38
MED16-211ENST00000606828 TRIM41Q8WV44 630 aa23.69■■□□□ 1.38
MED16-211ENST00000606828 ARHGEF11O15085 1522 aa23.62■■□□□ 1.37
MED16-211ENST00000606828 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.6■■□□□ 1.37
MED16-211ENST00000606828 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.6■■□□□ 1.37
MED16-211ENST00000606828 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.6■■□□□ 1.37
MED16-211ENST00000606828 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.59■■□□□ 1.37
MED16-211ENST00000606828 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.56■■□□□ 1.36
MED16-211ENST00000606828 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.55■■□□□ 1.36
MED16-211ENST00000606828 ADAMTS12P58397 1594 aa23.55■■□□□ 1.36
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MED16-211ENST00000606828 KIF27Q86VH2 1401 aa23.5■■□□□ 1.35
MED16-211ENST00000606828 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.48■■□□□ 1.35
MED16-211ENST00000606828 NUP160Q12769 1436 aa23.44■■□□□ 1.34
MED16-211ENST00000606828 IGF1RP08069 1367 aa23.42■■□□□ 1.34
MED16-211ENST00000606828 ARAP1Q96P48 1450 aa23.41■■□□□ 1.34
MED16-211ENST00000606828 CEP170Q5SW79 1584 aa23.4■■□□□ 1.34
MED16-211ENST00000606828 CUL7Q14999 1698 aa23.31■■□□□ 1.32
MED16-211ENST00000606828 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.28■■□□□ 1.32
MED16-211ENST00000606828 JPH4Q96JJ6 628 aa23.24■■□□□ 1.31
MED16-211ENST00000606828 SHROOM2Q13796 1616 aa23.23■■□□□ 1.31
MED16-211ENST00000606828 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.21■■□□□ 1.31
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