RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614825.4

DDB2-208, Transcript of damage specific DNA binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene DDB2, Length 852 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2-208ENST00000614825 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.51■■■□□ 2.15
DDB2-208ENST00000614825 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.43■■□□□ 1.66
DDB2-208ENST00000614825 ABCC9O60706 1549 aa25.39■■□□□ 1.66
DDB2-208ENST00000614825 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.23■■□□□ 1.47
DDB2-208ENST00000614825 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.17■■□□□ 1.46
DDB2-208ENST00000614825 NACADO15069 1562 aa24.02■■□□□ 1.44
DDB2-208ENST00000614825 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.73■■□□□ 1.39
DDB2-208ENST00000614825 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.68■■□□□ 1.38
DDB2-208ENST00000614825 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
DDB2-208ENST00000614825 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.6■■□□□ 1.37
DDB2-208ENST00000614825 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.59■■□□□ 1.37
DDB2-208ENST00000614825 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.48■■□□□ 1.35
DDB2-208ENST00000614825 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.42■■□□□ 1.34
DDB2-208ENST00000614825 SCRIBQ14160 1630 aa23.33■■□□□ 1.32
DDB2-208ENST00000614825 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.06■■□□□ 1.28
DDB2-208ENST00000614825 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.88■■□□□ 1.25
DDB2-208ENST00000614825 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
DDB2-208ENST00000614825 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.81■■□□□ 1.24
DDB2-208ENST00000614825 SMARCA4P51532 1647 aa22.2■■□□□ 1.14
DDB2-208ENST00000614825 NCAPD3P42695 1498 aa22.17■■□□□ 1.14
DDB2-208ENST00000614825 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.17■■□□□ 1.14
DDB2-208ENST00000614825 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
DDB2-208ENST00000614825 SMARCA2P51531 1590 aa22.12■■□□□ 1.13
DDB2-208ENST00000614825 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
DDB2-208ENST00000614825 HMGXB3Q12766 1538 aa22.01■■□□□ 1.11
DDB2-208ENST00000614825 MROH2BQ7Z745 1585 aa22■■□□□ 1.11
DDB2-208ENST00000614825 ERCC6Q03468 1493 aa21.92■■□□□ 1.1
DDB2-208ENST00000614825 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.9■■□□□ 1.1
DDB2-208ENST00000614825 NESP48681 1621 aa21.84■■□□□ 1.09
DDB2-208ENST00000614825 WIZO95785 1651 aa21.76■■□□□ 1.07
DDB2-208ENST00000614825 CUX2O14529 1486 aa21.69■■□□□ 1.06
DDB2-208ENST00000614825 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.65■■□□□ 1.06
DDB2-208ENST00000614825 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
DDB2-208ENST00000614825 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.57■■□□□ 1.04
DDB2-208ENST00000614825 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.56■■□□□ 1.04
DDB2-208ENST00000614825 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.53■■□□□ 1.04
DDB2-208ENST00000614825 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
DDB2-208ENST00000614825 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.49■■□□□ 1.03
DDB2-208ENST00000614825 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
DDB2-208ENST00000614825 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.37■■□□□ 1.01
DDB2-208ENST00000614825 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.34■■□□□ 1.01
DDB2-208ENST00000614825 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.33■■□□□ 1.01
DDB2-208ENST00000614825 CFTRP13569 1480 aa21.32■■□□□ 1
DDB2-208ENST00000614825 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.26■□□□□ 0.99
DDB2-208ENST00000614825 WDR62O43379 1518 aa21.25■□□□□ 0.99
DDB2-208ENST00000614825 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
DDB2-208ENST00000614825 PRDM2Q13029 1718 aa21.09■□□□□ 0.97
DDB2-208ENST00000614825 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
DDB2-208ENST00000614825 TOPBP1Q92547 1522 aa20.94■□□□□ 0.94
DDB2-208ENST00000614825 IFT140Q96RY7 1462 aa20.88■□□□□ 0.93
DDB2-208ENST00000614825 ABCC8Q09428 1581 aa20.88■□□□□ 0.93
DDB2-208ENST00000614825 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.86■□□□□ 0.93
DDB2-208ENST00000614825 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
DDB2-208ENST00000614825 OSCARQ8IYS5 282 aa20.84■□□□□ 0.93
DDB2-208ENST00000614825 TRIM41Q8WV44 630 aa20.8■□□□□ 0.92
DDB2-208ENST00000614825 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
DDB2-208ENST00000614825 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.73■□□□□ 0.913e-7■■■■■ 36.6
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DDB2-208ENST00000614825 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.71■□□□□ 0.91
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DDB2-208ENST00000614825 SOGA1O94964 1423 aa20.69■□□□□ 0.9
DDB2-208ENST00000614825 FBLN2P98095 1184 aa20.67■□□□□ 0.9
DDB2-208ENST00000614825 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.66■□□□□ 0.9
DDB2-208ENST00000614825 CUX1P39880 1505 aa20.66■□□□□ 0.9
DDB2-208ENST00000614825 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
DDB2-208ENST00000614825 CHD1O14646 1710 aa20.53■□□□□ 0.88
DDB2-208ENST00000614825 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.5■□□□□ 0.87
DDB2-208ENST00000614825 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.49■□□□□ 0.87
DDB2-208ENST00000614825 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.49■□□□□ 0.87
DDB2-208ENST00000614825 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.49■□□□□ 0.87
DDB2-208ENST00000614825 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
DDB2-208ENST00000614825 GRIN2BQ13224 1484 aa20.45■□□□□ 0.86
DDB2-208ENST00000614825 WDR97A6NE52 1622 aa20.45■□□□□ 0.86
DDB2-208ENST00000614825 ARHGEF11O15085 1522 aa20.44■□□□□ 0.86
DDB2-208ENST00000614825 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.43■□□□□ 0.86
DDB2-208ENST00000614825 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
DDB2-208ENST00000614825 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
DDB2-208ENST00000614825 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.39■□□□□ 0.85
DDB2-208ENST00000614825 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.39■□□□□ 0.85
DDB2-208ENST00000614825 SYNJ1O43426 1573 aa20.38■□□□□ 0.85
DDB2-208ENST00000614825 PBRM1Q86U86 1689 aa20.37■□□□□ 0.85
DDB2-208ENST00000614825 TOP2BQ02880 1626 aa20.35■□□□□ 0.85
DDB2-208ENST00000614825 SYNJ2O15056 1496 aa20.35■□□□□ 0.85
DDB2-208ENST00000614825 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.34■□□□□ 0.85
DDB2-208ENST00000614825 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.32■□□□□ 0.84
DDB2-208ENST00000614825 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.26■□□□□ 0.83
DDB2-208ENST00000614825 ARAP1Q96P48 1450 aa20.25■□□□□ 0.83
DDB2-208ENST00000614825 GRIN2AQ12879 1464 aa20.18■□□□□ 0.82
DDB2-208ENST00000614825 ADAMTS12P58397 1594 aa20.18■□□□□ 0.82
DDB2-208ENST00000614825 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.16■□□□□ 0.82
DDB2-208ENST00000614825 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
DDB2-208ENST00000614825 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.13■□□□□ 0.81
DDB2-208ENST00000614825 CEP170Q5SW79 1584 aa20.09■□□□□ 0.81
DDB2-208ENST00000614825 NUP160Q12769 1436 aa20.07■□□□□ 0.8
DDB2-208ENST00000614825 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.03■□□□□ 0.8
DDB2-208ENST00000614825 KIF27Q86VH2 1401 aa20.02■□□□□ 0.8
DDB2-208ENST00000614825 IGF1RP08069 1367 aa19.97■□□□□ 0.79
DDB2-208ENST00000614825 JPH4Q96JJ6 628 aa19.96■□□□□ 0.79
DDB2-208ENST00000614825 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
DDB2-208ENST00000614825 SHROOM2Q13796 1616 aa19.93■□□□□ 0.78
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