Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCBP4P57723 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCBP4P57723 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.7 ms