Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NF2P35240 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NF2P35240 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NF2P35240 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NF2P35240 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NF2P35240 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NF2P35240 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NF2P35240 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NF2P35240 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NF2P35240 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NF2P35240 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NF2P35240 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NF2P35240 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NF2P35240 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NF2P35240 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NF2P35240 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NF2P35240 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NF2P35240 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NF2P35240 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NF2P35240 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NF2P35240 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NF2P35240 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NF2P35240 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NF2P35240 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NF2P35240 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NF2P35240 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NF2P35240 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NF2P35240 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NF2P35240 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NF2P35240 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NF2P35240 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NF2P35240 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NF2P35240 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NF2P35240 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NF2P35240 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NF2P35240 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NF2P35240 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NF2P35240 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NF2P35240 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NF2P35240 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NF2P35240 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NF2P35240 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NF2P35240 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NF2P35240 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NF2P35240 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NF2P35240 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NF2P35240 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NF2P35240 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NF2P35240 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NF2P35240 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NF2P35240 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NF2P35240 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NF2P35240 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NF2P35240 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NF2P35240 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NF2P35240 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NF2P35240 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NF2P35240 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NF2P35240 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NF2P35240 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NF2P35240 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NF2P35240 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NF2P35240 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NF2P35240 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NF2P35240 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NF2P35240 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NF2P35240 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NF2P35240 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NF2P35240 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NF2P35240 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NF2P35240 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NF2P35240 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NF2P35240 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NF2P35240 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NF2P35240 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NF2P35240 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NF2P35240 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NF2P35240 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NF2P35240 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NF2P35240 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NF2P35240 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NF2P35240 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NF2P35240 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NF2P35240 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NF2P35240 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NF2P35240 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NF2P35240 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NF2P35240 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NF2P35240 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NF2P35240 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NF2P35240 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NF2P35240 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NF2P35240 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NF2P35240 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NF2P35240 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NF2P35240 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NF2P35240 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NF2P35240 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NF2P35240 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NF2P35240 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms