Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
N4BP1O75113 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
N4BP1O75113 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 611.6 ms