Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COA4Q9NYJ1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COA4Q9NYJ1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms