Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX6

TMEM167B, Protein kish-B, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM167BQ9NRX6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM167BQ9NRX6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM167BQ9NRX6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms