Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RTN4Q9NQC3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN4Q9NQC3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms