Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA90

EFCC1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCC1Q9HA90 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EFCC1Q9HA90 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EFCC1Q9HA90 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EFCC1Q9HA90 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EFCC1Q9HA90 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
EFCC1Q9HA90 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EFCC1Q9HA90 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EFCC1Q9HA90 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
EFCC1Q9HA90 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EFCC1Q9HA90 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EFCC1Q9HA90 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EFCC1Q9HA90 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EFCC1Q9HA90 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EFCC1Q9HA90 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
EFCC1Q9HA90 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
EFCC1Q9HA90 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EFCC1Q9HA90 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EFCC1Q9HA90 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
EFCC1Q9HA90 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EFCC1Q9HA90 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EFCC1Q9HA90 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EFCC1Q9HA90 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EFCC1Q9HA90 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EFCC1Q9HA90 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EFCC1Q9HA90 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EFCC1Q9HA90 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EFCC1Q9HA90 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EFCC1Q9HA90 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EFCC1Q9HA90 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms