Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3GL3Q99963 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3GL3Q99963 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3GL3Q99963 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms