Protein–RNA interactions for Protein: Q96NM4

TOX2, TOX high mobility group box family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOX2Q96NM4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOX2Q96NM4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TOX2Q96NM4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOX2Q96NM4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOX2Q96NM4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOX2Q96NM4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOX2Q96NM4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOX2Q96NM4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOX2Q96NM4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms