Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK2

RIPOR3, RIPOR family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR3Q96MK2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPOR3Q96MK2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RIPOR3Q96MK2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPOR3Q96MK2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms