Protein–RNA interactions for Protein: Q92759

GTF2H4, General transcription factor IIH subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H4Q92759 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
GTF2H4Q92759 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2H4Q92759 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms