Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NTRK2Q16620 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NTRK2Q16620 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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