Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
MKRN3Q13064 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
MKRN3Q13064 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
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