Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBE3AQ05086 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms