Protein–RNA interactions for Protein: P61289

PSME3, Proteasome activator complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3P61289 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME3P61289 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME3P61289 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME3P61289 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME3P61289 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME3P61289 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME3P61289 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME3P61289 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSME3P61289 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME3P61289 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME3P61289 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME3P61289 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME3P61289 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME3P61289 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME3P61289 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME3P61289 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME3P61289 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME3P61289 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME3P61289 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME3P61289 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME3P61289 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME3P61289 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME3P61289 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME3P61289 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME3P61289 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME3P61289 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME3P61289 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME3P61289 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME3P61289 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME3P61289 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME3P61289 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME3P61289 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME3P61289 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME3P61289 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME3P61289 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME3P61289 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME3P61289 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME3P61289 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME3P61289 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME3P61289 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME3P61289 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME3P61289 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME3P61289 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME3P61289 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME3P61289 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME3P61289 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME3P61289 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME3P61289 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME3P61289 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME3P61289 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME3P61289 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME3P61289 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME3P61289 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME3P61289 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME3P61289 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME3P61289 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME3P61289 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME3P61289 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME3P61289 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME3P61289 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME3P61289 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME3P61289 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME3P61289 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME3P61289 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME3P61289 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME3P61289 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME3P61289 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME3P61289 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME3P61289 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME3P61289 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME3P61289 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME3P61289 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME3P61289 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME3P61289 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME3P61289 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME3P61289 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME3P61289 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME3P61289 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME3P61289 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME3P61289 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME3P61289 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME3P61289 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME3P61289 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME3P61289 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME3P61289 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME3P61289 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME3P61289 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME3P61289 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME3P61289 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME3P61289 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME3P61289 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME3P61289 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME3P61289 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME3P61289 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME3P61289 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME3P61289 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME3P61289 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME3P61289 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME3P61289 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSME3P61289 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms