Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP2P42575 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP2P42575 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP2P42575 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP2P42575 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP2P42575 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP2P42575 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP2P42575 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP2P42575 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP2P42575 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP2P42575 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP2P42575 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP2P42575 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP2P42575 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP2P42575 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP2P42575 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP2P42575 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP2P42575 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP2P42575 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP2P42575 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP2P42575 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP2P42575 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP2P42575 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP2P42575 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP2P42575 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP2P42575 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP2P42575 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP2P42575 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP2P42575 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP2P42575 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP2P42575 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP2P42575 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP2P42575 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP2P42575 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP2P42575 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP2P42575 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP2P42575 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP2P42575 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP2P42575 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP2P42575 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP2P42575 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP2P42575 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP2P42575 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP2P42575 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP2P42575 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP2P42575 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP2P42575 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP2P42575 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP2P42575 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP2P42575 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP2P42575 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP2P42575 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP2P42575 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP2P42575 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP2P42575 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP2P42575 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP2P42575 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP2P42575 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP2P42575 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP2P42575 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP2P42575 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP2P42575 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP2P42575 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP2P42575 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP2P42575 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP2P42575 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP2P42575 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP2P42575 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP2P42575 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP2P42575 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP2P42575 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP2P42575 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP2P42575 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP2P42575 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP2P42575 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP2P42575 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP2P42575 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP2P42575 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP2P42575 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP2P42575 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP2P42575 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP2P42575 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP2P42575 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP2P42575 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP2P42575 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP2P42575 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP2P42575 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP2P42575 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP2P42575 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP2P42575 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP2P42575 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP2P42575 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP2P42575 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP2P42575 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP2P42575 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP2P42575 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP2P42575 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP2P42575 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP2P42575 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP2P42575 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms