Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00869P0C866 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00869P0C866 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms